鸟枪法战略（Shotgun Strategy）又称随机测序战略，是由美国塞莱拉遗传公司创始人克雷格•文特尔发明，主要针对大片段的全长测序
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1. 根据基因序列设计特异性的引物和荧光探针；2. 提取样品的RNA/DNA，并反转录成cDNA3. Real-Time PCR，进行实验结果分析；4. 提供完整的实验报告。
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环境微生物群落多样性分析，基于Roche 454 FLX +、Illumina MiSeq等第二代高通量测序平台，对核糖体RNA高变区域，比如16S/18S/ITS等序列；或功能基因，比如细菌和古菌的氨氧化酶基因进行测序，揭示环境样品中众多不同类型微生物种类以及它们之间的相对丰度和进化关系。
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宏基因组测序即利用测序技术对环境样品中全部微生物的基因组进行测定，以分析微生物群体的基因组成及功能，解读微生物群体的多样性和丰度，探索微生物与环境及宿主之间的关系，发掘和研究新的具有特定功能的基因等
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大肠杆菌（E.coli），作为分子生物学研究的重要工具，基因组注释明确，各种基因操作手段成熟。作为传统的模式生物，大多数基因的功能验证都能够以大肠杆菌作为宿主完成验证。
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细菌人工染色体（Bacterial Artificial Chromosome，BAC）文库的构建是进行基因组研究的一项重要基础性工作，特别是对大基因组及超大基因组来说更是如此，在物理作图、基因图位克隆、基因结构和调控等研究中发挥了重要作用。
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